CherryTree
特点：开源免费，支持富文本编辑、语法高亮、数据存储灵活，支持多文件存储和强大的搜索功能。
适用人群：科研工作者、程序员、学生、作家等需要进行大量笔记整理的人士。
Trilium Notes
特点：支持无限层级的树状结构，单个笔记能够放置在多个位置，具备强大的标签和属性系统，便于灵活的知识关联和分类。
适用人群：需要高效管理大量笔记的用户。
敬业签
特点：支持在Windows和Mac电脑端使用，创建多个不同的笔记分类，每条笔记中支持添加多种格式的文件附件。
适用人群：需要跨平台记录和管理笔记的用户。
Evernote
特点：功能强大，界面友好，支持多种格式的文件存储和同步，适合需要强大文件管理功能的用户。
适用人群：需要跨设备同步和管理的用户。
Notion
特点：灵活的项目管理功能，支持多种内容类型和格式，适合需要灵活项目管理功能的用户。
适用人群：需要高度自定义和灵活性的用户。
OneNote
特点：微软出品，功能全面，支持多种格式的文件存储和同步，适合需要全面笔记管理功能的用户。
适用人群：需要稳定且全面的笔记管理功能的用户。
根据你的具体需求，可以选择适合你的笔记软件来进行分层做笔记。例如，如果你需要强大的文件管理功能和跨设备同步，可以选择Evernote或OneNote；如果你需要灵活的项目管理和知识关联，可以选择Trilium Notes或敬业签。