要开发一个Java编程档案管理系统，你需要遵循以下步骤：
需求分析
确定系统需要实现的功能，例如文档的添加、修改、删除、查询等。
确定系统的用户群体和他们的权限。
考虑数据的安全性和系统的性能要求。
系统设计
设计系统的整体架构，选择合适的技术栈，如Java、Spring Boot、MySQL等。
设计数据库模型，包括文档表、用户表、分类表等。
设计系统的用户界面，可以使用JSP、Thymeleaf、Vue.js等前端技术。
编码实现
创建Document类来表示文档，包含文档的基本信息如ID、标题、内容、分类和创建时间。
实现DocumentManager类来管理文档的存储和检索，包括添加、修改、删除和查询文档的方法。
使用Spring Boot框架搭建后端服务，实现RESTful API。
开发前端界面，提供用户友好的操作界面。
测试
编写单元测试和集成测试，确保系统的各个功能正常运行。
进行性能测试，确保系统能够处理预期的用户负载。
部署
将系统部署到服务器上，可以使用Docker容器化部署，以便于管理和扩展。
配置数据库连接和系统参数。
维护
根据用户反馈对系统进行维护和更新。
定期备份数据，确保数据安全。
```java
// Document.java
public class Document {
private String id；
private String title；
private String content；
private String category；
private LocalDateTime createTime；
public Document（String title, String content, String category） {
this.id = UUID.randomUUID（）.toString（）；
this.title = title；
this.content = content；
this.category = category；
this.createTime = LocalDateTime.now（）；
}
// getter和setter方法省略
}
// DocumentManager.java
import java.util.List；
import java.util.UUID；
public class DocumentManager {
private List
public void addDocument（Document document） {
document.setId（UUID.randomUUID（）.toString（））；
documents.add（document）；
}
public void updateDocument（Document document） {
// 更新文档逻辑
}
public void deleteDocument（String id） {
documents.removeIf（doc -> doc.getId（）.equals（id））；
}
public Document getDocumentById（String id） {
for （Document doc : documents） {
if （doc.getId（）.equals（id）） {
return doc；
}
}
return null；
}
// 其他管理方法省略
}
```
请注意，这只是一个非常基础的示例，实际的档案管理系统的功能会更加复杂，需要考虑更多的细节和异常处理。此外，你还需要根据实际需求选择合适的前端技术和数据库设计。