电影《苹果》被禁的原因是多方面的，主要包括以下几点：
内容问题
典妻故事：电影中的“典妻”故事被认为违背了社会主义意识形态本质。
城乡对立：渲染城乡对立冲突的情节设计被认为违背了社会主义精神文明建设的主流导向。
镜头语言：电影中的镜头语言无意中丑化了国家政治中心北京。
性爱场面：电视编导担任电影导演在表现性爱场面方面的自然主义手法有诲淫之嫌。
审查问题
未经审查参加国际电影节评奖：电影未经审查就参加了国际电影节评奖，并擅自在互联网上传播未通过审查的色情内容。
违规传播：电影在未通过审查的情况下，通过互联网传播，违反了相关规定。
市场炒作
情色炒作：从影片开机到首映再到公映，关于该片的消息始终围绕情色展开，这种炒作可能加剧了电影的争议性。
制片方责任
咎由自取：制片人因未经审查就参加国际电影节评奖和擅自在互联网上传播未通过审查的内容，被勒令在影院停止发行放映，并且两年内不得从事相关电影业务。
综上所述，电影《苹果》被禁的原因涉及内容、审查、市场炒作和制片方责任等多个方面。这些因素共同作用，最终导致电影被禁止在影院上映。