琵琶在十二生肖中代表的动物是 蛇。这一结论主要基于以下两点依据：
1. 琵琶与佛教四大护法之一的东方持国天王多罗吒相关联，而多罗吒手持琵琶，居住在东胜神洲。在佛教文化中，蛇常常与东方持国天王联系在一起，因此可以推断琵琶与蛇有关联。
2. 虽然存在关于琵琶与牛相关的说法，例如琵琶曲能催人泪下，让人想起辛酸的日子，但这并不足以作为琵琶代表牛的依据。此外，琵琶与牛的联系更多是基于文化象征和寓意，而非直接关联。
综合以上信息，可以得出结论：琵琶在十二生肖中代表的动物是蛇。