苹果iPhone 6s搭载的是苹果自家的A9处理器。这款处理器是苹果的旗舰级芯片，拥有两个高性能核心和两个高能效核心，GPU为PowerVR GT7600，能够轻松应对各种日常使用和游戏需求。此外，iPhone 6s还内置了M9协处理器，用于收集来自加速感应器、陀螺仪、指南针和全新气压计等数据，可以实现“全天候监测”延长续航。
具体来说，A9处理器采用了14nm制程工艺，拥有双核心设计，CPU最高频率可达1.8GHz。与上一代的A8处理器相比，A9在性能上有显著提升，单核性能提升了20%，多核性能提升了90%以上，并且在图像处理方面也有出色的表现，速度提升了两倍之多。
综合来看，苹果iPhone 6s的A9处理器在当时是非常先进的，提供了强劲的性能和高效的能效，为用户带来了良好的使用体验。