驻马店被称为“总部”的原因主要有以下几点：
治安问题：
多年前的驻马店经济较为贫穷，人员素质偏低，法律意识淡薄，骗子数量多，坑骗行为猖獗，严重损害了驻马店的城市形象，因此有人调侃“河南十亿九亿骗，总部设在驻马店”。
历史背景：
上个世纪二十年代，驻马店竹沟建立起了群众组织和红军游击队，后来这里的红军游击队也加入新四军，中共河南省委也迁往驻马店竹沟，这里成为了中国共产党在中原地区的总部。
地理位置：
驻马店地处黄淮平原南部，是河南省下辖的一个地级市，位于华中地区，地形以丘陵平原为主，东依安徽阜阳，西连河南南阳，南邻河南信阳，北接周口、漯河、平顶山等城市，总面积15083平方千米，有着“国家卫生城市”和“全国文明城市”等荣誉称号。
网络调侃：
随着网络的发展，驻马店因其治安问题和贫困形象，成为网友调侃的对象，诸如“河南十亿九亿骗，总部设在驻马店”等段子在网络上广泛流传。
综上所述，驻马店被称为“总部”的原因是多方面的，包括其治安问题、历史背景、地理位置以及网络调侃等因素。